미국 질병 통제 예방 센터 (CDC)는 컨소시엄을 시작하여 SARS-CoV-2 서열 데이터를 퍼블릭 도메인으로 신속하게 공개 할 수있는 시퀀싱 실험실의 전국 네트워크를 시작했습니다. 개방형 코로나 바이러스 시퀀스 데이터의 신속한 출시가 도움이 될 것입니다. Covid-19 공중 보건 대응, 혁신 및 발견 추진, 현재와 미래의 전염병에 대한 이해 증진.
이 공중 보건 비상 대응, 역학 및 감시 (SPHERES)를위한 SARS-CoV-2 시퀀싱 컨소시엄은 전체 게놈 시퀀싱 (WGS) COVID-19 바이러스의. SPHERES는 전국의 COVID-19 사례 및 클러스터를 조사하는 공중 보건 대응 팀에 일관된 실시간 시퀀스 데이터를 제공합니다.
이 새로운 컨소시엄은 국가 및 지역 사회에서 바이러스가 어떻게 확산되고 있는지 더 잘 이해하는 데 도움이 될 것입니다. 결과적으로 더 나은 데이터는 공중 보건 공무원이 전염 사슬을 차단하고 새로운 질병 사례를 예방하며 생명을 보호하고 구하는 데 도움이 될 것입니다.
“미국은 고급 고속 게놈 시퀀싱 분야에서 세계 최고의 리더입니다. 우리의 공공, 민간, 임상 및 학술 공중 보건 연구소에서 이러한 조정 된 노력은 SARS-CoV-2의 전파, 진화 및 치료를 이해하는 데 중요한 역할을 할 것입니다. 저는 우리의 가장 훌륭하고 숙련 된 사람들이 현재와 미래의 생명을 구하기 위해 협력하고 있다고 확신합니다.”라고 CDC 디렉터 인 Robert Redfield, MD가 말했습니다.
COVID-19 바이러스가 진화함에 따라 추적
게놈 서열 데이터는 COVID-2를 유발하는 바이러스 인 SARS-CoV-19의 생물학에 대한 전례없는 통찰력을 제공하고 전염병의 변화하는 환경을 정의하는 데 도움을 줄 수 있습니다. 미국 전역에서 바이러스를 시퀀싱함으로써 CDC 및 기타 공중 보건 당국은 바이러스의 중요한 변화를 모니터링하고이 정보를 사용하여 연락처 추적, 공중 보건 완화 노력 및 감염 제어 전략을 안내 할 수 있습니다.
SPHERES 컨소시엄은 전국적으로 SARS-CoV-2 게놈 시퀀싱을 조정하기위한 야심 찬 노력으로 수십 개의 소규모 개별 노력을 실험실, 기관 및 기업의 단일 분산 네트워크로 조직합니다. 이 컨소시엄은 40 개 주 및 지역 공중 보건 부서, 여러 대형 임상 실험실, 연방 정부, 학계 및 민간 부문에 걸쳐 XNUMX 개 이상의 협력 기관의 전문 지식, 기술 및 자원을 결합합니다.
SPHERES는 모범 사례 및 합의 데이터 표준을 수립하고, 개방형 데이터 공유를 가속화하며, 최첨단 기술을 국가 COVID-19 대응에 적용하는 데 도움이되는 리소스 및 전문 지식 풀을 구축 할 것입니다.
SPHERES 데이터 개방, 공유
컨소시엄 회원들은 신속한 오픈 시퀀스 공유에 대한 약속을 공유합니다. 그들은 모든 유용한 시퀀스 데이터를 국립 의학 도서관의 국립 생명 공학 정보 센터 (NLM / NCBI), 조류 인플루엔자 데이터 공유에 관한 글로벌 이니셔티브 (GISAID) 및 기타 공개 시퀀스 저장소에있는 공용 저장소에 제출할 계획입니다. 이를 통해 미국 전역의 바이러스 염기 서열 데이터를 공중 보건 의사 결정에 신속하게 사용할 수 있고 모든 곳의 연구원이 자유롭게 액세스 할 수 있습니다.
컨소시엄 회원은 다음과 같습니다.
연방 기관 및 실험실
질병 통제 및 예방 센터, 고급 분자 탐지 실
아르곤 국립 연구소 (Argonne National Laboratory)
국방 보건국, 글로벌 감염성 질병 감시
식품 의약품 안전청
로렌스 버클리 국립 연구소
Los Alamos National Laboratory
국립 알레르기 및 전염병 연구소, 게놈 및 첨단 기술 사무소
국립 표준 기술 연구소
국립 의학 도서관의 국립 생명 공학 정보 센터
월터 리드 육군 연구소
주 / 지방 공중 보건 연구소
애리조나
캘리포니아
델라웨어
컬럼비아 특별구
플로리다 주는
하와이
메인
메릴랜드
매사추세츠 주
미시간
미네소타
노스 캐롤라이나
노스 다코타
네바다
뉴 멕시코
뉴욕
유타
버지니아의
워싱턴주의 NHPI 커뮤니티 구성원을 대상으로 발생한 사건입니다
위스콘신
와이오밍
학술 기관
베일러 대학
Cornell University
프레드 허친슨 암 연구소
마운트 시나이 의과 대학
뉴욕 대학
노던 애리조나 대학
버팔로 대학
캘리포니아 대학, 버클리
캘리포니아 데이비스 대학
캘리포니아 대학, 얼바인
캘리포니아 대학, 로스 앤젤레스
캘리포니아 샌프란시스코 대학
캘리포니아 대학, 산타 크루즈
시카고 대학
메릴랜드 대학
미네소타 대학
네브래스카 대학
뉴 멕시코 대학
워싱턴 대학
예일 대학교
기업
애보트 진단
바이오메리외
컬러 유전체학
은행 바이오 웍스
아이디바이DNA
인큐텔
LabCorp
하나의 코덱스
Oxford Nanopore 기술
태평양 생명 과학
퀴 아젠
퀘스트 진단
진정한 생명 과학
회사 이름은 정보 제공 목적으로 만 제공되며 여기에 회사 이름이 포함되었다고해서 미국 질병 통제 및 예방 센터에서 회사 또는 그 어떤 상업용 제품이나 서비스를 보증하는 것은 아닙니다.
비영리 공중 보건 또는 연구 기관
공중 보건 연구소 협회
빌과 멜린다 게이츠 재단
광범위한 연구소
찬 주커 버그 바이오 허브
크레이그 벤터 연구소
유전체 역학을위한 공중 보건 연합
스크립스 연구
잭슨 연구소
중개 유전체학 연구소 – 북부
Walder 재단
지난 2 년 동안 CDC의 고급 분자 검출 사무소 (Office of Advanced Molecular Detection) 프로그램은 전염병 감시 및 발병 대응을 위해 병원체 유전체학 및 기타 고급 실험실 기술의 사용을 확대하기 위해 연방 및 주 공중 보건 연구소에 투자했습니다. 현재 컨소시엄 투자는 SARS-CoV-XNUMX 유행병에서 생명을 구하고 향후 유행병 대응을 위해 미국과 세계를 준비하는 것을 목표로합니다.
게놈 시퀀싱 또는 고급 분자 검출 분야의 CDC 작업에 대해 자세히 알아 보려면 다음을 방문하십시오. https://www.cdc.gov/amd/
